一是直线电机的耗电量大，尤其在进行高荷载、高加速度的运动时，机床瞬间电流对车间的供电系统带来沉重负荷;
其二是振动高，直线电机的动态刚性极低，不能起缓冲阻尼作用，在高速运动时会造成机床其它部分共振;
直线电机的特点在于直接产生直线运动，与间接产生直线运动的“旋转电动机，滚动丝杠”相比，其优点是(具体性能见下表)：
(1)没有机械接触，传动力是在气隙中产生的，线性模组除了直线电机导轨以外没有一点其它的摩擦；
(2)结构相对比较简单，体积小，通过以最少的零部件数量来实现我们的直线驱动，而且这仅仅是只存在一个运动的部件；
(7)精度和重复精度高，因为消除了影响精度的中间环节，系统的精度取决于位置检测元件，有合适的反馈装置可达亚微米级；
(8)维护简单，由于部件少，运动时无机械接触，从而大幅度的降低了零部件的磨损，只需很少甚至不需要维护，常规使用的寿命更长。直线电动机与“旋转电动机，滚珠丝杠”传动性能比较表性能旋转电动机滚珠丝杠直线)运行的行程在理论上是不受任何限制的，而且其性能不会因为其行程的大小改变而受到影响；
(4)其运转能够给大家提供很宽的转速运行范围，其涵盖包括从每秒几微米到数米，特别是在高速状态下是其一个突出的优点；
(6)运动平稳，是因为除了起支撑作用的直线导轨或气浮轴承外，伺服电动缸没有其它机械连接或转换装置的缘故；
其三是发热量大，微型电钢固定在工作台底部的直线电机动子是高发热部件，安装的地方不利于自然散热，对机床的恒温控制造成很大挑战;
其四是不能自锁紧，为了能够更好的保证操作安全，直线电机驱动的运动轴，尤其是垂直运动轴，必须要额外配备锁紧机构，增加了机床的复杂性。
在直线电机的应用中，人们除了发现上述缺陷外，单轴手臂也看到了其优点的片面性。直线电机的主要优点是高速度和高加速度，但在机床工艺流程中，加速度超过10m/s2时所节省的辅助时间对整个工艺流程的工时来说并没有太大意义，只有在工时非常短的加工中，高加速度才有意义，也就是说对于模具、风叶等单件复杂零件的切削加工，直线电机的优点并不明显。基于以上原因，直交机械手选择发展直线电机的机床企业都采用扬长避短的手法，一是将直线电机应用在面向大批量生产、定位运动多、方向频繁转变的场合，如汽车零部件加工机床，快速原型机及半导体生产机等;二是用于荷载低、工艺范围大的场合，例如电加工机床、水切割机、等离子切割机等。